Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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