Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MICAQ29983 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MICAQ29983 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MICAQ29983 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms