Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms