Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms