Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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