Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK3Q16288 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK3Q16288 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms