Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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