Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETFDHQ16134 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFDHQ16134 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms