Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 AFG1L-202ENST00000421954 1741 ntTSL 56.43□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 AFG1L-205ENST00000437715 742 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 415.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 SPIRE2-210ENST00000569108 2409 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WWP2-203ENST00000544162 2723 ntTSL 210.64□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.026e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 219.13■□□□□ 0.656e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-213ENST00000568964 853 ntTSL 218.16■□□□□ 0.56e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-210ENST00000567595 663 ntTSL 316.96■□□□□ 0.316e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.266e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 215.65■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 515.44■□□□□ 0.066e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LMF1-205ENST00000562380 551 ntTSL 44.05□□□□□ -1.766e-9■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 318.56■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 418.32■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 516.52■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 515.64■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 515.64■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 215.49■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 515.43■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 414.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 410.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 222.14■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CELSR2-204ENST00000498157 3680 ntTSL 212.29□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 LINC01341-204ENST00000505748 595 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 219.57■□□□□ 0.726e-13■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.36e-13■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 ARL6IP6-202ENST00000425034 465 ntTSL 25.38□□□□□ -1.556e-13■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 ARL6IP6-204ENST00000463690 1402 ntTSL 25.22□□□□□ -1.576e-13■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 ARL6IP6-203ENST00000455875 479 ntTSL 24.42□□□□□ -1.76e-13■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 SAMD4B-207ENST00000598605 555 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TP53BP2-205ENST00000465119 465 ntTSL 520.98■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-202ENST00000392599 828 ntTSL 320.24■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-206ENST00000442778 578 ntTSL 417.4■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-211ENST00000462821 623 ntTSL 316.5■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-208ENST00000453846 558 ntTSL 416.5■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SLC4A2-205ENST00000463414 793 ntTSL 316.13■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-207ENST00000447486 2246 ntTSL 215.7■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-203ENST00000392604 1697 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-205ENST00000442541 563 ntTSL 515.47■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SLC4A2-215ENST00000488420 610 ntTSL 314.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-209ENST00000460188 622 ntTSL 413.79□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TP53BP2-206ENST00000472180 467 ntTSL 213.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SLC4A2-212ENST00000482950 500 ntTSL 413.23□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.845e-15■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TP53BP2-207ENST00000473135 567 ntTSL 48.6□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 47.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TP53BP2-213ENST00000496282 481 ntTSL 36.27□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CCDC14-205ENST00000419247 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.84□□□□□ -1.475e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CCDC14-215ENST00000479903 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.43□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 METTL8-210ENST00000460539 677 ntTSL 35.31□□□□□ -1.564e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 48.65□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 25.83□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 33.76□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-222ENST00000642141 921 nt9.53□□□□□ -0.881e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-207ENST00000507401 711 ntTSL 37.45□□□□□ -1.221e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-213ENST00000636759 3606 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-212ENST00000636194 8508 ntTSL 55.65□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 28.3
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