Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCAPHQ15003 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCAPHQ15003 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCAPHQ15003 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCAPHQ15003 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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NCAPHQ15003 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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