Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NWD1Q149M9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NWD1Q149M9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
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