Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSPNQ14714 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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