Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERV3-1Q14264 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms