Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms