Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
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