Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3CQ13748 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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