Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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