Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTCH1Q13635 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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