Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms