Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRSQ13332 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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