Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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