Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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