Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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