Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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