Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSTF3Q12996 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms