Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPRL3Q12980 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms