Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPN13Q12923 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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