Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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