Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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