Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms