Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms