Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms