Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms