Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms