Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms