Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms