Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF9Q00978 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms