Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSG4Q00888 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms