Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRX3P78415 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRX3P78415 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms