Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS28P62857 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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