Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms