Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms