Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms