Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELLP55199 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms