Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms