Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.966e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 520.16■□□□□ 0.826e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 218.94■□□□□ 0.626e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 331.39■■■□□ 2.621e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 425.04■■□□□ 1.61e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-205ENST00000484210 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 36.79□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)25.83■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.661e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 422.14■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 11e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-211ENST00000482037 603 ntTSL 521.02■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-212ENST00000482872 839 ntTSL 520.8■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 217.71■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.182e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.295e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TNKS-205ENST00000518027 766 ntTSL 310.51□□□□□ -0.732e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 37.83□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 SDHAP1-206ENST00000435731 548 ntTSL 334.32■■■■□ 3.083e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.87■■■□□ 2.213e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 SDHAP1-202ENST00000413474 813 ntTSL 527.92■■■□□ 2.063e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 SDHAP1-205ENST00000427841 2491 ntTSL 223.84■■□□□ 1.413e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 235.72■■■■□ 3.314e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-209ENST00000470388 872 ntTSL 528.18■■■□□ 2.14e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 227.73■■■□□ 2.034e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-203ENST00000563908 524 ntTSL 226.78■■□□□ 1.885e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-219ENST00000492888 872 ntTSL 326.53■■□□□ 1.844e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-202ENST00000563762 1174 ntTSL 224.76■■□□□ 1.555e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.054e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.965e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-208ENST00000567027 1353 ntTSL 220.6■□□□□ 0.895e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-212ENST00000568260 674 ntTSL 320.14■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-207ENST00000566672 1397 ntTSL 220.08■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-208ENST00000469892 889 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-211ENST00000567411 1743 ntTSL 519.32■□□□□ 0.685e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.65e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 517.36■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-216ENST00000569509 590 ntTSL 417.17■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-215ENST00000569410 1351 ntTSL 515.67■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.183e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 328.39■■■□□ 2.143e-8■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 229.62■■■□□ 2.331e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 29.87□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-9■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-9■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-9■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 ADNP-205ENST00000534467 773 ntTSL 36.68□□□□□ -1.342e-9■■■■□ 22.7
HNRNPMP52272 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 221.03■□□□□ 0.968e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 FDFT1-221ENST00000532266 583 ntTSL 512.92□□□□□ -0.348e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ANKRD28-203ENST00000439830 592 ntTSL 540.36■■■■■ 4.057e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.887e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 25.89□□□□□ -1.477e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 NPLOC4-203ENST00000570300 565 ntTSL 416.28■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 410.5□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 PTPRG-205ENST00000475527 2694 ntTSL 526.28■■□□□ 1.89e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 MCF2L-218ENST00000442625 2710 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 GRB2-211ENST00000583912 561 ntTSL 413.39□□□□□ -0.273e-8■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 340.92■■■■■ 4.141e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 IFITM10-203ENST00000482459 1563 ntTSL 1 (best)36.32■■■■□ 3.42e-12■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.271e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 534.77■■■■□ 3.161e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.081e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ZNF274-214ENST00000621145 1646 ntTSL 232.04■■■□□ 2.721e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 ZNF274-213ENST00000619307 1566 ntTSL 231.86■■■□□ 2.691e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 IFITM10-204ENST00000486852 369 ntTSL 531.22■■■□□ 2.592e-12■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 AKAP8L-216ENST00000599488 514 ntTSL 430.94■■■□□ 2.541e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 530.35■■■□□ 2.451e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 229.97■■■□□ 2.391e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.351e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 529.6■■■□□ 2.331e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.321e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 AKAP8L-215ENST00000599137 608 ntTSL 429.26■■■□□ 2.271e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 229.15■■■□□ 2.261e-6■■■■□ 22.6
HNRNPMP52272 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.151e-6■■■■□ 22.6
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 208.8 ms