Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE6CP51160 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms