Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRIM1P49642 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms