Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA4P48169 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms