Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTRNP46939 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms